リアルタイムじゃなくて、逆転写な。

間違い探しではないが、リアルタイムＰＣＲとＲＴ−ＰＣＲは違う。
念のため、私はバイオ系の研究者ではない、ただの技術屋のおっさんなので、誤りがあるかもしれない。専門家の方がご指摘いただけるなら歓迎する。

コロナウイルスはＲＮＡウイルスなので、持っている遺伝子情報は１本鎖のＲＮＡ。
ＰＣＲ（ポリメラーゼ連鎖反応）で増幅（数を増やすこと）ができるのは２本鎖のＤＮＡのみ。ＰＣＲはＤＮＡ合成に関わる酵素ポリメラーゼとＤＮＡ／ＲＮＡの材料をもとになるＤＮＡと一緒にして、温度を正確に上げ下げする。温度が上がるとＤＮＡはほどけ、温度が下がるときにポリメラーゼが働いてほどけた遺伝情報に対して材料がくっついていき、２本のＤＮＡができる。これを繰り返して倍々ゲームのようにＤＮＡを増やす。
ＲＮＡからだとこの技術はつかえないので、いったん逆転写酵素を使ってＤＮＡに組み込んでやるのが「逆転写ＰＣＲ」である（なぜ使えないか、は私にはまだ理解できていない）。

リアルタイムＰＣＲは研究機関・企業などでは「ｒ−ＰＣＲ」と書くことが多いようだ。
これはＰＣＲの時間短縮技術、と考えればだいたいあってるはずだ。

コロナウイルスはいろいろ電子顕微鏡写真・図も出ているが、丸い形で、まわりに突起が出ている。中には遺伝子であるＲＮＡが入っている。丸い形は宿主の細胞膜由来の脂質（脂質２重層）でできている。まわりに生えている突起の中で、融合たんぱく質と呼ばれるものの働きで宿主の細胞膜とウイルスのエンベロープが融合することでウイルスＲＮＡが細胞内に入り、感染となる。
参照＞http://jsv.umin.jp/journal/v59-2pdf/virus59-2_205-214.pdf
もちろん、まだ分かっていないことも多いようだし、この論文はＨＩＶに関する知見が元になっているので、コロナウイルスの場合は別の過程があるかもしれない。

「まわりに生えている」ものだが、これの一部は免疫でいうところの抗原である。そのウイルスに特有の抗原があり、結合できる抗体があるなら、検査はそれを見つければいいことになる。
が、コロナウイルスは本当に「どこにでもいる」ウイルスの一種で、発熱を伴わない普通の風邪の病原体のひとつでもある。今回のＳＡＲＳ−ＣｏＶ−２ではまだ「特有の抗原」は見つかっていないので、抗原・抗体反応での検査が「まだ」できない。
だからこそ、中身のＲＮＡを調べる必要があるのだが、そのためには次のような手順が必要だ。
・検体からＲＮＡを抽出する前に逆転写用のＲＮＡなどの試薬を調整・検体と混ぜる
・エタノールを加えてエンベロープを破壊し、検体からのＲＮＡを取り出す
・遠心分離して検体由来のＲＮＡが含まれている部分を取り出す
・逆転写操作を行う
・ＤＮＡになったものをＰＣＲで増幅する。温度を正確に上げ下げしなければならず、４０回×２繰り返すので、時間がかかる（合計４時間程度）
・増えたＤＮＡを電気的に引っ張って分ける（アガロースゲルを使った電気泳動）
・ゲル中にできた帯（バンド）を調べて陽性かどうか判断する
参照＞https://www.niid.go.jp/niid/images/lab-manual/2019-nCoV20200225.pdf
これらの手順、最後の判断段階以外ではほとんどすべてのＲＮＡウイルスのＲＮＡ（逆転写されたＤＮＡ）をなんでもかんでも増幅してしまう。「無関係のウイルス」がまじっていれば判別はしにくくなる。途中の段階でなんらかのミスが起きるかもしれない。
検体が正しくウイルスを捕まえてきたかどうかは、検査した医師の手腕はもちろん、そこにウイルスがいるかどうかという「患者の状態」によっても不明確になる。

アメリカのＣＤＣなどが出している検査方法は感染研のものより短い時間でできるようだが、どれだけの正確性があるかは不明だ。米ＣＤＣも２月末の時点では、アメリカ全土で５００件ほどの検査しかできておらず日本よりはるかに少ない。

日本には病原性ウイルスの検査を扱える施設は多くない。ＢＳＬ（バイオセーフティレベル）という厳しい区分けがあるからだ。
ＣＯＶＩＤ−１９と診断される患者からとった検体を扱えるのはＢＳＬ−３以上に限られ、日本には民間を含めても１４カ所しかない。ＢＳＬ−４は感染研の戸山庁舎１カ所だけだ。
ＢＳＬ−３以上でもすべての施設にＲＴ−ＰＣＲ検査ができる設備があるとは限らない。必要な薬品が揃っているとも限らない。
北海道で１日３件ぐらいしか検査ができなかったのは、ＰＣＲに使う機器（サーマルサイクラーなど）が足りなかったからだと推測可能だ。

以上のように、ＳＡＲＳ−ＣｏＶ−２検査は簡単にできるものではない。時間も設備も人手（熟練者）も必要だ。感染研などはフル稼働しているだろうが、それでも「誰でもいつでもお望み通り」検査ができる状態ではない。
お隣の国などの例を見てもわかるとおり、誰でも検査します！なんて言ったら医療体制そのものが崩壊する。検査中（現時点では２日ぐらい）は入院させなければならないので、病院のベッドが足りなくなる。絶対にやってはいけない。

感染研では「感染疑い」の検体をＢＳＬ−２で扱える、と規則を改正した。が、ＢＳＬ−２の研究室でＲＴ−ＰＣＲができる研究室・施設がどれだけあるだろうか？
私もＢＳＬ−２の研究室に出入りはしているが、そこでは無害な細菌（表皮常在菌など）しか扱っていないし、ＰＣＲの設備もない（同じ建物の中でＰＣＲを研究している研究室はあるが、大学なので当然、本業の研究が優先される）。

民間に補助金出すぞ！と言っても、ＰＣＲ用の器材・薬品を購入する分だけだろうし、ＢＳＬ−３を取得するのは簡単ではない。感染症法などに従って申請し、厚労省が認可しているはずだ。
そのへんもしっかりやらないと、なかなかうまくいかないんじゃなかろうか・・・

民間会社にも検査機器購入補助　政府調整　停滞解消狙う　新型コロナ
https://news.mixi.jp/view_news.pl?media_id=2&from=diary&id=6000765