日本の上空で核が破裂しても、、、？

PAC3を展開 北ミサイルに備え
http://news.mixi.jp/view_news.pl?media_id=2&from=diary&id=4713607

素人なんでよくわからないが、日本の上空を通過する北朝鮮ミサイルをPAC3とやらで撃ち落とすことができたとしてもだ。ミサイルに核弾頭がつんであったら、日本の上空で核が破裂するわけですわな。
迎撃できるから大丈夫とはとても思えないんだけと。

それとも、はるか高いところで原爆程度の放射能が飛散しても平気なのか。素人目にはとてもそうは思えない。
これ、かなりおバカな疑問なのかも、と思うと恥ずかしくて人に聞けないや。